Gastroenterologia dziecięca w Polsce to specjalizacja, która zmaga się z wieloma wyzwaniami - zarówno w zakresie diagnostyki, jak i leczenia chorób układu pokarmowego. Problemem jest i rosnąca liczba pacjentów, i konieczność posiadania nowoczesnego sprzętu, którego użycie poprawia wyniki leczenia, w tym tych pacjentów, którzy wymagają wsparcia chirurgicznego.
Choroby przewodu pokarmowego u dzieci - takie jak celiakia, choroba Leśniowskiego-Crohna, wrzodziejące zapalenie jelita grubego, refluks żołądkowo-przełykowy i inne choroby przełyku oraz żołądka, ciężkie alergie pokarmowe, choroby trzustki i wątroby czy zaburzenia czynnościowe (np. zespół jelita wrażliwego) - są coraz częstsze.
Tematem ściśle powiązanym z gastroenterologią dziecięcą są problemy żywienia, zarówno niedożywienie, jak i otyłość. Dzieci z chorobami przewodu pokarmowego często cierpią na niedożywienie, ponieważ ich organizm ma trudności z trawieniem i wchłanianiem składników odżywczych. W dłuższej perspektywie zaburzenia wchłaniania prowadzą do spadku masy ciała, zahamowania wzrostu, niedoborów witamin i minerałów oraz osłabienia odporności.